陈宜瑜认为，更加侧重基础，就是要不断夯实提升基础研究整体水平的学科基础。要在科学基金工作中重视基础学科或传统学科，加强薄弱学科或濒危学科，关注基本的数据积累和数据库建设工作，夯实基础研究的发展基础，防止出现“短板效应”。

　　“更加侧重前沿，是培育科技制高点、提升国家科技竞争力的必然要求。”陈宜瑜提出，要前瞻部署和支持能够引领科技、经济、社会发展的科学前沿研究。要在统筹全面布局和重点部署的基础上推进学科交叉融合，发展新兴学科和学科的生长点；要在纷繁的研究热点中寻找科学的前沿，凝练和解决促进战略性新兴产业振兴的前沿科学问题，瞄准和抢占科技制高点；要关注高风险、高回报的变革性研究，捕捉创新机遇，及时有力资助，增强原始创新能力。

　　2009年，国家自然基金委加大了对青年人才的扶持力度，资助青年科学基金6079项，比上年增长27.8%，资助金额12.03亿元。陈宜瑜提出，更加侧重人才，就是要打造培养创新人才和团队的资助链。要切实尊重创新人才成长和基础研究队伍建设规律，坚持培养后备人才和激励科研一线人才相结合，稳定国内人才和吸引海外人才相结合，促进学术领军人才成长和培育创新团队相结合，完善人才培养资助体系和评价机制，形成贯穿科研职业生涯的科学基金人才链，促进建设一支规模宏大、结构合理、素质优良的科技队伍，为建设创新型国家提供强有力的人才保证和智力支撑。